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    While using MediaSPIP, you are invited to avoid using words like "Brand", "Cloud" and "Market".
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    MediaSPIP aims to be accessible to as many people as possible and development is based on expanding the (...)

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    12 mars 2015, par Matt Stone

    I’m trying to write a simple immune system simulator. I’m modeling infected tissue as a simple grid of cells and various intracellular signals, and I’d like to animate movement of cells in one plot and the intensity of viral presence in another as the infection progresses. I’m doing so with the matshow function provided by matplotlib. However, when I plot the two next to each other, the full grid gets clipped unless I stretch out the window myself. I can’t address the problem at all when saving to an mp4.

    Here’s the default view, which is identical to what I observe when saving to mp4 :

    And here’s what it looks like after stretching out the viewer window

    I’m running Python 2.7.9 with matplotlib 1.4.2 on OS X 10.10.2, using ffmpeg 2.5.2 (installed via Homebrew). Below is the code I’m using to generate the animation. I tried using plt.tight_layout() but it didn’t affect the problem. If anyone has any advice as to how to solve this, I’d really appreciate it ! I’d especially like to be able to save it without viewing with plt.show(). Thanks !

    def animate(self, fname=None, frames=100):
       fig, (agent_ax, signal_ax) = plt.subplots(1, 2, sharey=True)

       agent_ax.set_ylim(0, self.grid.shape[0])
       agent_ax.set_xlim(0, self.grid.shape[1])
       signal_ax.set_ylim(0, self.grid.shape[0])
       signal_ax.set_xlim(0, self.grid.shape[1])

       agent_mat = agent_ax.matshow(self.display_grid(),
                                    vmin=0, vmax=10)
       signal_mat = signal_ax.matshow(self.signal_display(virus),
                                      vmin=0, vmax=20)
       fig.colorbar(signal_mat)

       def anim_update(tick):
           self.update()
           self.diffuse()
           agent_mat.set_data(self.display_grid())
           signal_mat.set_data(self.signal_display(virus))
           return agent_mat, signal_mat

       anim = animation.FuncAnimation(fig, anim_update, frames=frames,
                                      interval=3000, blit=False)

       if fname:
           anim.save(fname, fps=5, extra_args=['-vcodec', 'libx264'])
       else:
           plt.show()
  • arm : Use full filenames as multiple inclusion guards

    13 janvier 2014, par Diego Biurrun
    arm : Use full filenames as multiple inclusion guards
    
    • [DBH] libavcodec/arm/dsputil_arm.h
    • [DBH] libavcodec/arm/hpeldsp_arm.h
    • [DBH] libavcodec/arm/mpegvideo_arm.h
  • use my full first name instead of short one in copyrights

    1er juin 2013, par Kostya Shishkov
    use my full first name instead of short one in copyrights
    
    • [DBH] libavcodec/binkdata.h
    • [DBH] libavcodec/binkdsp.c
    • [DBH] libavcodec/binkdsp.h
    • [DBH] libavformat/rtmp.h
    • [DBH] libavformat/rtmppkt.c
    • [DBH] libavformat/rtmppkt.h
    • [DBH] libavformat/rtmpproto.c